指导全市水利（渔业）工程建设管理工作；监督市级重点工程及江河堤防、城市防洪、水库、水力发电工程等水利工程（不含应急度汛、地方水电项目）的建设管理；负责水库日常运行的监督管理；拟订全市水库有关建设与管理相关制度和技术标准并监督实施；负责全市水利工程建设招标投标管理；指导全市水利工程建设的质量监督；监督管理全市水利建设市场:负责水利工程勘察设计、施工、监理、工程质量检测单位和招标代理机构的行业监督管理；指导水利工程建设项目及运行管理的执法监督；协调、指导全市防汛抗旱工作；负责市区重要河流的河道整治和管理。

负责拟定水利水产科学技术发展规划；组织协调重大水利水产技术推广工作。

组织协调全市农田水利基本建设；指导农村饮水安全、节水灌溉、排水及雨洪资源利用等工程建设与管理；指导农村水利社会化服务体系建设，指导水电农村电气化和小水电代燃料工作。

组织指导全市水土流失综合防治工作；组织编制水土保持规划并监督实施；组织水土流失监测、预报并公告；审核重要建设项目水土保持方案并监督实施。

指导全市水利（渔业）行业安全生产工作；组织开展水利工程建设和水库、水电站等水利工程安全监督检查；负责调查处理并协调解决重大水利安全事故；履行法规规定的行政许可职责中涉及安全的有关事项。

拟订全市渔业发展的政策、规划、计划并组织实施；指导渔业标准化生产和健康养殖；负责渔业水域生态环境和水生野生动植物保护；组织水产品质量安全的监督管理；指导水生动植物的防疫检疫和病害防控工作；负责渔业执法、监察和渔政队伍建设工作；组织、指导渔业基础设施建设与管理；指导水产技术推广和水产品加工流通；协调处理重大渔事纠纷；承担水产综合统计，发布水产信息。代表国家处理渔业涉外事务。